ご指摘のように、JDBCドライバによる型変換でjava.time.LocalDateTimeが渡される問題について、こちらでも把握しておりました。
MySQLのバージョンが5.7であれば、JDBCドライバは5系を使用していただけるとこの問題は生じないと思いますが、調査できていない組み合わせで何か不具合があるかもしれません。その際はお手数ですがお知らせいただけると助かります。
MySQLのバージョンが8.0であればJDBCドライバは8系をご使用いただき、MySQL8.0用のMZ側修正パッチをご利用ください。最新版のスマート製造ツールキット(MZIoTtoolkit)ZIPファイルをダウンロードして展開しますと、commonフォルダの中に講習資料と必要なファイルが含まれていますので、お試しいただければと思います。