ご連絡ありがとうございます。
まず、最初に疑われるのが、MySQLのJDBCドライバーのバージョンです。新規に作製されたデータベースに適合する最新のバージョンをお使いください。
MySQLのJDBCドライバーのMZ Platform内での配置位置ですが、
MZ4.0では”MZPlatform\4.0\jars\ext”の下に、
MZ3.6‗64では”MZPlatform\Java\jre8_mz3.6_64\lib\ext”の下に配置をお願いしています。
(4.0でも3.6と同様の位置に配置しても問題はありません)
他の可能性についても検討いたしますが、取り急ぎご確認をお願いいたします。