はい、フレームのメソッド起動で可能です。
「フレームを表示する()」の前でも後でも、「setFrameLocation(int,int)」で画面内のフレーム左上の位置を指定できます。このメソッドは日本語化されていませんので、起動メソッド情報の画面で「全メソッド対象」をチェックしていただくと一覧から選択できるようになります。Javadocでの説明も合わせてご確認ください。
file:///C:/MZPlatform/3.6/docs/javadoc/jp/go/aist/dmrc/platform/beans/gui/container/PFFrame.html#setFrameLocation-int-int-