返信が遅くなり、失礼いたしました。
無限ループに入ってしまった場合、現在のところMZPlatformを強制終了するしかありませんが、
作成中のファイルはlogフォルダに保存されている可能性があります。
アプリケーションビルダーで「実行」時と終了時にMZPlatform\3.6(_64)\logフォルダに「ApplicationBackup.mzas」というファイル名で2代前まで保存されます。
アプリケーションビルダーを立ち上げ、このファイルをロードしてみてください。
アプリケーションビルダーの「実行」ボタンを押すと、バックアップファイルは上書きされてしまいますので、ご注意ください。